La localidad de Santo Tomé, Corrientes, se encuentra sobre el río Uruguay, a 340 kilómetros de Corrientes Capital. Se llega por las Rutas Nacional N° 12, Provincial N° 38 y Nacional N° 14.
Santo Tomé, Corrientes, limita al norte y al oeste con el departamento de Ituzaingó, al sur con San Martín y General Alvear, al noreste con la provincia de Misiones y al este con Brasil.